Una vez que se ha diagnosticado la presencia de al menos 3 episodios sintomáticos, es importante realizar un estudio de flujo vaginal para: 

1.- Detectar el tipo de cándida que está produciendo la infección: no todas las cándidas son sensibles a todos los antifúngicos. La más común y sensible a todos los tratamientos, es la Cándida albicans.

2.- Descartar que no existan otras bacterias que puedan estar produciendo síntomas: en este sentido es importante NO TRATAR BACTERIAS QUE SON PARTE DE LA FLORA COMENSAL, como Ureaplasmas y Mycoplasmas, ya que el uso repetido de antibióticos, predispone a más infecciones por cándida y se entra en un círculo vicioso donde cada tratamiento predispone a una nueva infección.

3.- Eventualmente solicitar estudio de susceptibilidad a laboratorios especializados.

Una vez que se tiene confirmado el que los síntomas son producidos por una Cándida albicans, el primer paso para el tratamiento de la candidiasis recurrente es la administración de fluconazol de forma prolongada, la mayoría de las pacientes responde a una dosis de fluconazol de 150 mg a la semana. 
Este tratamiento se puede extender por un período variable de 3 a 4 meses, tras lo cual se puede suspender y ver cómo se comporta la infección. 

Lamentablemente, hasta el 50% de las mujeres, volverán a presentar síntomas de vulvovaginits al poco tiempo de suspendido los medicamentos. 

En estas pacientes, el tratamiento con fluconazol se puede mantener, dejando ciclos de 3 a 4 meses de forma indefinida, probando realizar suspensiones periódicas del tratamiento para evaluar respuestas. 

Si bien los tratamientos con fluconazol son efectivos en controlar los síntomas en la mayoría de las pacientes al inicio, con el tiempo, se corre el riesgo de que el hongo se vuelva resistente y el fluconazol deje de cumplir su efecto. 
Cuando esto ocurre, opciones de tratamiento pueden ser: 

Antifúngicos tópicos: Las cremas o supositorios antifúngicos se usan comúnmente en mujeres embarazadas o como alternativa a los tratamientos orales. Son una opción válida, ya que pueden ser igual de efectivos.

Ácido bórico vaginal: Este tratamiento se reserva para casos especiales, como infecciones resistentes o cuando no se toleran otros tratamientos. No se recomienda su uso para infecciones habituales por Candida albicans. Precaución: El ácido bórico es tóxico si se ingiere y puede causar irritación local. Las parejas sexuales también pueden experimentar molestias si tienen contacto con él.

• Dosis: Se usa un supositorio de ácido bórico (600 mg) diariamente durante 2-3 semanas. Para mantener los resultados, se puede seguir con un tratamiento de mantenimiento durante 2-3 meses, reduciendo gradualmente la frecuencia hasta suspenderlo.

Violeta de genciana: Antes de los antifúngicos modernos, se usaba este producto tópico. Aunque es menos común hoy en día porque puede manchar la ropa y es menos efectivo, puede ayudar en casos resistentes. Se aplica diariamente en el área afectada durante 10-14 días.

Nistatina vaginal: Es una alternativa al ácido bórico. Se administra como supositorio durante 14 noches. En casos recurrentes, puede ser necesario continuar con un tratamiento de mantenimiento por 6 meses o más.

Sin embargo es importante destacar, que ninguno de éstos tratamientos ofrece curación definitiva y muchas veces logran controlar los síntomas mientras se utilizan, pero los síntmas vuelven una vez que se suspenden.